課堂 | 人工智能顯微成像能夠高效檢測稀有事件

通過基于人工智能的顯微成像檢測稀有事件，這種工作流程將智能樣本導航、圖像采集工具和人工智能驅動的圖像分析等不同功能融合起來共同協作，能夠克服上述局限性。

STELLARIS上Aivia驅動的自主顯微鏡為日常實驗室工作提供了非常高效的運行方式，包括執行那些沒有自動程序或大量人工操作就無法完成的高級實驗。

在生命科學領域使用成像技術的根本原因是能夠生成數據來回答生物學問題。通常會將圖像采集與高級圖像分析結合起來實現這個目標。

常規成像方法需要操作人員不斷進行人機交互，使用顯微鏡系統在樣本上搜索合適的對象或感興趣區域（ROI），進行適當的最佳圖像采集設置，然后決定掃描這些ROI。這種人工決策的實驗工作流程的性質決定了只有容易控制的少數ROI能被精確定位，而且采集ROI圖像需要大量時間。使用由Aivia驅動的自主顯微鏡，則能夠在實驗一開始完成設置后就wanquan自動進行稀有事件檢測工作流程。

實驗開始后，就會立即進行低分辨率預掃描、檢測稀有事件以及采集和存儲高分辨率3D圖像，無需任何人工干預。這種方法的顯著優勢在于整個過程高速進行，并能在實驗過程中檢測到大量稀有事件。

自主顯微鏡可自動檢測這類ROI或稀有事件（RE），無需人工干預，因此能使復雜的顯微鏡工作流程wanquan自動化。

在這個自主工作流程中，第一步先生成低分辨率二維（2D）概覽圖像，并立即將其傳輸到所連接的基于人工智能的圖像處理（Aivia）系統。該系統通過像素分類器檢測由操作人員預先定義好的稀有事件，并將稀有事件坐標發回成像系統，系統再根據操作人員zhiding的要求（例如高分辨率和三維（3D）數據堆棧）掃描這些稀有事件。通過這種方式生成的數據：

對稀有事件進行高度特異性掃描可大幅提高所采集數據的整體質量，因為獲得的都是真正感興趣的數據。這種方法可確保有針對性地掃描，至多獲得到90%的稀有事件。同時，不再因對稀有事件進行耗時且高成本的人工搜索而造成很長的“閑置時間"，因此顯微鏡系統可實現高效運行。

除了對稀有事件進行高度特異性掃描外，自主顯微成像還能采集與稀有事件目標wanquan無關的數據。可通過以目標為導向的方式掃描感興趣的對象，這一方面可以在很大程度上防止生成無效數據，另一方面能以高度定性的方式提供所采集的數據，便于后續圖像分析。所采集的對象始終位于掃描區域的視野（FOV）中心，因此可以實現上述優點。

可重復性是進行可信的生命科學研究的關鍵要素之一。自主執行的實驗順序可隨時得到恢復，裝配適當的軟件版本，并以wanquan相同的設置重新運行。這個過程能確保可重復性，而手動設置實驗中的成像程序無法做到這一點。此外還可建立高度復雜的顯微成像工作流程并使其自動化，使高級應用更易于使用，而這類應用以前根本無法做到，或者必須依靠大量人工操作。

LAS X Navigator是一款強大的導航和圖像采集工具，用戶可以從逐個圖像搜索方式切換到快速查看完整的樣本概覽，并能立即識別重要的樣本細節。它能夠使用玻片、培養皿和多孔板的模板自動設置高分辨率圖像采集。它就像一個用于樣本細胞的GPS定位系統，用戶始終都可通過一條清晰的路徑來獲得高質量數據、在樣本中導航、創建快速概覽、立即識別細節，還可以使用玻片、培養皿和多孔板的模板進行高分辨率圖像采集。

Navigator Expert基于Navigator，融合了提供稀有事件處理工作流程的Aivia人工智能圖像處理功能。此外，使用Navigator Expert還可以定義多個掃描任務，將其分配給需要掃描的任意幾何形狀/掃描區域，用于復雜的成像程序和實驗設置。

Navigator Expert包含兩個模塊：“Jobs"（任務）和“Experiment"（實驗）。在“Jobs"模塊中，可通過普通的STELLARIS LAS X用戶界面設置任何掃描任務。例如，該模塊包括定義自動對焦（AF）任務、低分辨率2D快速概覽掃描任務以及實際稀有事件任務，后者可以進行高分辨率3D掃描。

稀有事件檢測工作流程的創建十分簡單。定義了需完成的任務后，“Experiment"模塊就會直觀地引導用戶完成各個工作流程步驟：

要創建Aivia稀有事件處理程序，只需使用事先通過概覽掃描任務采集的一些圖像對Aivia像素分類器進行訓練。使用簡單的繪圖工具，對需要的稀有事件進行標注，并確定圖像的背景。這樣，像素分類器就可以從概覽掃描圖像中獨立檢測到稀有事件。

啟動稀有事件檢測工作流程后，概覽掃描圖像會立即傳輸到Aivia，后者將檢測到的稀有事件的像素坐標送回到Navigator Expert，以便進行稀有事件掃描。

除了上述特點之外，基于人工智能的自動顯微鏡還可大幅改進和優化實驗。

STELLARIS 平臺